Les antibiotiques guérissent une infection dentaire en ciblant et en tuant les bactéries spécifiques qui ont causé l'infection. Souvent, ils sont utilisés en conjonction avec un traitement physique, tel qu'un traitement de canal ou un drainage du pus, pour arrêter l'infection et restaurer la santé de la dent.
La clindamycine et les antibiotiques à base de pénicilline sont le plus souvent utilisés pour traiter les infections buccales, y compris l'amoxicilline. La pénicilline et l'amoxicilline sont toutes deux des antibiotiques bêta-lactamines et tuent certains types de bactéries en attaquant les parois cellulaires des bactéries et en ne les laissant pas synthétiser les composants pour fabriquer de nouvelles parois cellulaires. Sans leurs parois cellulaires, ces espèces de bactéries meurent rapidement. La clindamycine interfère avec la capacité de certaines espèces de bactéries à fabriquer de nouvelles protéines, ce qui les empêche de se développer. Le système immunitaire humain tue alors rapidement les bactéries restantes.
Les antibiotiques associés à un autre traitement, comme un traitement de canal, sont très efficaces pour éliminer l'infection des gencives et de la mâchoire. Cependant, si les antibiotiques ne sont pas pris correctement, l'infection peut réapparaître. Si les antibiotiques sont inefficaces, il existe un risque que la bactérie responsable de l'infection dentaire devienne résistante à cette classe d'antibiotiques à l'avenir. Si la bactérie devient résistante aux antibiotiques, l'infection suivante sera beaucoup plus difficile à traiter.