Les plans d'eau du Moyen-Orient comprennent le fleuve Amou-Daria, l'Euphrate, l'Indus, le Tigre, le golfe Persique et le Nil. Le plus grand lac du Moyen-Orient est le lac Urmia dans le nord-ouest de l'Iran, qui a une superficie de 2 000 milles carrés et une profondeur maximale de 52 pieds.
Les plans d'eau qui bordent les pays du Moyen-Orient comprennent l'océan Indien, la mer Méditerranée, la mer Rouge, la mer Noire, le golfe d'Aden, la mer d'Arabie, le golfe Persique et la mer Caspienne.
Le canal de Suez, un plan d'eau artificiel en Égypte qui relie la mer Méditerranée et la mer Rouge, a ouvert le passage aux navires commerciaux en 1869. Il mesure 100,82 milles de long, avec deux canaux d'accès de 14 milles et 5,6 milles .
Le Nil, long de 4 258 miles, qui traverse l'Égypte est le plus long fleuve du monde. Son embouchure est située au bord de l'Égypte avec la mer Méditerranée.
Le fleuve Euphrate traverse la Turquie, la Syrie et l'Irak, terminant sa route dans le golfe Persique. L'ancienne ville de Babylone se trouve sur les rives du fleuve.
Les fleuves Indus et Tigre fusionnent pour devenir le fleuve Chatt al Arab, qui se jette également dans le golfe Persique. Le Tigre a une longueur de 1 180 milles.