Bien qu'il y ait eu une occupation japonaise de la République des Philippines entre 1942 et 1945 qui a été largement ressentie par les Philippins, depuis la fin de la Seconde Guerre mondiale, le Japon est un partenaire commercial essentiel qui a contribué à stimuler l'économie philippine . Le Japon a également apporté son soutien en 1980 au nouveau gouvernement philippin. Récemment, le Japon a également fourni une aide indispensable aux Philippines pour la reconstruction après le typhon Haiyan.
Les Japonais ont envahi les Philippines le 8 décembre 1941 dans le cadre d'une opération stratégique contre les États-Unis. Cette invasion a commencé moins d'un jour après l'attaque japonaise sur Pearl Harbor, et finalement les Japonais ont établi une forte présence militaire aux Philippines. Alors que les Japonais ont promis l'indépendance des îles après la guerre, la plupart des ressortissants philippins en voulaient à l'occupation et beaucoup se sont activement battus contre les Japonais. Finalement, les Japonais se sont rendus et ont perdu le contrôle des Philippines en 1945.
Depuis la fin de la guerre et de l'occupation japonaise, les relations philippines-japonaises se sont renforcées. Les Japonais ont été un partenaire commercial essentiel pour aider à reconstruire et à stimuler l'économie philippine, et les Japonais ont aidé à reconstruire le gouvernement philippin dans les années 1980. Le Japon continue de fournir une aide humanitaire et économique aux Philippines, notamment pendant la période de restauration après le typhon Haiyan.