La température corporelle normale d'un cobaye se situe entre 99 et 103 degrés Fahrenheit, avec une température rectale moyenne de 103 F, selon l'École de médecine vétérinaire de LSU. Les cobayes se portent mieux à température ambiante. similaire à la température ambiante confortable pour les humains, environ 70 degrés Fahrenheit.
Les cobayes sont vulnérables aux coups de chaleur et tolèrent mieux les températures plus basses que les températures plus élevées. Les températures extérieures supérieures à 80 degrés sont risquées, même si l'animal est confiné à l'ombre. Parce qu'elles sont si vulnérables à la surchauffe, les cages pour cobayes doivent être conservées à l'abri de la lumière directe du soleil et doivent être situées dans une zone avec une bonne circulation d'air.
