Outre le risque posé par la consommation de la nourriture en décomposition dans laquelle ils ont été pondus, manger les œufs de la plupart des espèces de mouches n'est généralement pas plus nocif pour les adultes en bonne santé que de manger d'autres matières organiques. Certaines espèces de mouches , cependant, sont capables d'éclore ou de survivre au passage dans le tractus gastro-intestinal humain, selon les Centers for Disease Control and Prevention, et peuvent provoquer des symptômes désagréables en cas d'infestation.
L'infestation du corps par les mouches est connue sous le nom de myiase, et plusieurs espèces de mouches sont capables d'infecter les humains, rapporte le CDC. Dans un cas, une fillette d'un an de l'État de Washington a été amenée chez son médecin lorsque sa mère a vu des « vers mobiles » dans les selles de la fille. Ceux-ci se sont avérés être des asticots de l'espèce Muscina stabulans, ou fausses mouches d'étable, qui ont infesté le tractus gastro-intestinal de la jeune fille après avoir été nourrie de bananes trop mûres contenant les œufs de mouches non éclos. Comme l'a rapporté son médecin, la fille était asymptomatique et le problème s'est résolu sans traitement.
Parfois, cependant, la myiase interne provoquée par l'ingestion d'œufs de mouche provoque des crampes, des vomissements et de la diarrhée. Le CDC conseille de couvrir les fruits exposés et de laver soigneusement les fruits et légumes avant consommation. Manger délibérément des œufs de mouche est également déconseillé pour la plupart des gens.