Muhammad a quitté La Mecque, en 622 EC, après avoir été averti d'un complot visant à l'assassiner. La migration du Prophète et de ses disciples de La Mecque à Médine est connue sous le nom de Hijra ou Hégire.
Après avoir quitté sa maison à La Mecque, Muhammad s'est caché pendant trois jours dans la grotte de Thawr, située au sud de sa ville natale. Il a ensuite voyagé vers le nord et est arrivé à Quba' près de Médine le 2 juillet 622. Il a déménagé de Quba' à Médine, deux semaines plus tard.
Selon la foi islamique, Allah a ordonné au Prophète de quitter la Mecque pour Médine. Le complot visant à l'assassiner était le résultat de sa prédication des révélations que Dieu lui avait accordées. Il ne pouvait pas prêcher en public et il avait plusieurs adversaires et ennemis à La Mecque. Médine était l'endroit où Mahomet a commencé à attirer de plus en plus d'adeptes.
Pendant les dix années suivantes, la ville est restée la base de Mahomet, d'où ils ont marché jusqu'à La Mecque et l'ont conquise sans bataille. Aujourd'hui, Médine est considérée comme le deuxième lieu le plus saint de l'Islam et est souvent appelée la "Ville du Prophète", la maison de la "Mosquée du Prophète". Après la mort du prophète Mahomet, Médine est restée un centre important et était considérée comme la capitale de facto du califat.