Deoxys peut être capturé sur Birth Island, mais y arriver nécessite un élément d'événement qui peut être difficile à obtenir sans tricher. Les joueurs auront besoin du billet Aurora, qui n'a été distribué que lors d'événements Nintendo.
Le billet Aurora a été offert lors des événements "Pok?mon Rocks America" organisés entre 2003 et 2005. S'il n'y a pas été obtenu, il doit être échangé contre un autre joueur. Une autre possibilité est de le recevoir en tant que cadeau mystère dans l'un des jeux Nintendo DS, puis de le transférer à nouveau sur "Pok?mon Emerald" via un modèle DS avec un emplacement pour cartouche Game Boy Advance, mais ce processus nécessitera beaucoup d'essais et d'erreurs. La méthode la plus simple consiste à en obtenir un via un appareil Gameshark ou Action Replay.
Une fois le ticket Aurora obtenu, le joueur peut atteindre l'île de naissance en chevauchant le S.S. Tidal. Birth Island est une petite île en forme de triangle avec un seul rocher dessus. Lorsque les joueurs s'approchent du rocher, celui-ci se déplace et le joueur doit alors le suivre en faisant le moins de pas possible. Après plusieurs tours, Deoxys semble combattre le joueur et peut être capturé.
