Depuis le 1er siècle, lorsque les Romains ont expérimenté l'agrandissement de petits objets en les regardant à travers du verre, le microscope a considérablement changé avec les versions modernes de l'appareil capables de présenter des images tridimensionnelles d'objets au niveau subatomique . Les avancées les plus notables dans la technologie des microscopes ont eu lieu au 19e siècle.
Vision Engineering Ltd., un fabricant mondial de microscopes, propose une chronologie de la technologie des microscopes, en commençant par les Romains testant des morceaux de verre épais au milieu et fins le long des bords en examinant de petits objets à travers eux. Les premiers microscopes réels, cependant, étaient des loupes à une puissance, capables d'offrir une vision claire des insectes. En 1830, Joseph Jackson Lister a créé un microscope dans lequel les lentilles étaient suffisamment espacées pour éviter la distorsion de l'objet en vue. Au milieu du 19e siècle, les inventeurs ont créé le premier de ce qui ressemblait à des microscopes modernes. Plusieurs entreprises dans divers pays, dont les États-Unis, ont commencé à fabriquer ces instruments optiques.
Selon l'organisation du prix Nobel, Ernst Ruska a développé le microscope électronique en 1938. Avec cette version de l'appareil, les utilisateurs ont pu profiter d'une résolution considérablement améliorée. En 1981, Heinrich Rohrer a inventé le microscope à effet tunnel qui offre des images tridimensionnelles au niveau atomique.
Les microscopes d'aujourd'hui ont, selon Vision Engineering Ltd., atteint leur limite de conception avec peu de changements depuis l'invention de Rohrer. Cependant, les fabricants continuent d'essayer de rendre les appareils plus conviviaux, selon la société.