Il n'est pas possible d'aller dans la région de Johto dans "Pok?mon Leaf Green." Cependant, il est possible de capturer une grande variété de Pok?mon de la région de Johto après avoir vaincu le Elite Four en se rendant sur plusieurs îles appelées les îles Sevii.
La première île de Sevii peut être atteinte après que le joueur a vaincu Blaine, le leader du gymnase de Cinnabar Island. Une fois que le joueur aura vaincu l'Elite Four, il pourra accéder à toutes les îles Sevii. Les Pokémon originaires de la région de Johto se trouvent sur les îles Sevii, ainsi que l'un des trois Pokémon légendaires de chien de la région de Johto. Le chien Pok?mon sera soit Suicune, Entei ou Raikou. Le jeu choisit le chien qui a l'avantage de type sur le Pokémon que le joueur a choisi au début du jeu.
Le joueur peut faire bien plus que simplement attraper Johto Pok?mon sur les îles Sevii après avoir vaincu les Elite Four. Il peut également se rendre au mont Ember et récupérer le saphir des hommes de main de la Team Rocket ou obtenir le rubis dans un entrepôt de la Team Rocket. L'entrée de la grotte Cerulean est également débloquée afin que le joueur puisse s'y rendre et capturer le légendaire Pok?mon Mewtwo.
