Charles Krauthammer est né à New York en 1950 et a déménagé avec ses parents au Canada francophone lorsqu'il était enfant. Il était marié à la peintre et sculpteur Robyn Krauthammer et a un fils nommé Daniel qui était né en 1986. Charles et Robyn Krauthammer étaient tous deux des promoteurs de la musique et de la culture juives et sont co-fondateurs de « Pro Musica Hebraica », une organisation culturelle basée à Washington. Tous deux ont toujours eu un intérêt pour la culture et les traditions juives. Le Dr Krauthammer est décédé le 21 juin 2018 d'un cancer de l'intestin grêle.
Charles Krauthammer a grandi dans une famille juive orthodoxe stricte. Son père était d'ascendance française et sa mère est née en Belgique. Ils ont décidé de déménager de New York à Montréal quand Charles était jeune. Il a gardé une vie très privée et a rarement partagé des détails sur sa famille avec le public, à l'exception de quelques références à son fils Daniel dans son livre "Things That Matter". Il a épousé Robyn Krauthammer en 1974 et tous deux parlaient couramment l'hébreu. Ensemble, ils ont dirigé une organisation culturelle qui organise des concerts faisant la promotion de la musique juive. Les deux se sont rencontrés alors qu'ils fréquentaient l'Université d'Oxford en Angleterre. À l'époque, Robyn était une étudiante juive australienne qui travaillait également comme auxiliaire juridique pour le bureau du juge en chef.
