Le Japon est une nation insulaire d'Asie de l'Est. C'est un archipel composé de 6 852 îles au total. Il est bordé par l'océan Pacifique Nord, la mer des Philippines, la mer de Chine orientale et la mer du Japon. Les quatre îles d'accueil, Hokkaid?, Honsh?, Shikoku et Ky?sh?, représentent environ 97 pour cent de la masse terrestre du pays. La capitale de Tokyo est située sur Honsh ?.
Les montagnes et les forêts couvrent environ 72 % du Japon. La plus haute altitude du pays est le mont Fuji, situé sur Honsh?, dont le sommet culmine à 12 388 pieds au-dessus du niveau de la mer. Les autres grandes montagnes du pays comprennent le mont Tate et le mont Haku. Les montagnes Hida, Kiso et Akaishi font partie des Alpes japonaises, le mont Kita ayant le plus haut sommet de cette chaîne. Le Japon compte également 108 volcans actifs.
La rivière Shinano est la plus longue rivière du pays. Le plus grand lac est le lac Biwa. L'altitude la plus basse se trouve à Hachir?gata, qui était le deuxième plus grand lac du pays jusqu'au début de la remise en état des terres dans les années 1950. L'altitude du lac est de quatre mètres sous le niveau de la mer.
Le littoral japonais est long de 18 486 milles. La plupart des terres propices à l'habitation et à la culture se trouvent le long des côtes.