Le plus long fleuve d'Allemagne est le Rhin, qui s'écoule sur 537 milles à l'intérieur du pays. Bien que la majorité des sources universitaires et des documents de référence indiquent que la longueur totale du Rhin est de 820 milles, s'étend sur environ 765 miles de ses deux sources au delta de la rivière, selon un biologiste de l'Université de Cologne qui a découvert l'erreur en 2010.
Le deuxième fleuve le plus long d'Allemagne est l'Elbe, qui s'étend sur des miles 435, suivi du Danube, qui coule sur des miles 402. Les autres grands fleuves du pays sont l'Ems, l'Isr, le Lech, la Moselle, l'Oder, la Weser et la Spree.