Le conflit principal dans "Freak The Mighty" est le combat de deux garçons avec eux-mêmes et leurs handicaps respectifs. Kevin a un intellect extraordinaire mais est paralysé de naissance et porte des attelles de jambe. Max est physiquement puissant mais mentalement faible. Ensemble, ils apprennent à surmonter ces lacunes.
Les deux garçons de l'histoire deviennent amis et apprennent qu'ensemble, ils sont plus forts qu'ils ne pourraient l'être seuls. Ils résistent aux intimidateurs, se rendent compte qu'ils peuvent être meilleurs que leur passé et apprennent à être de meilleures personnes les uns des autres. Ensemble, ils cultivent une forte amitié et forment "Freak the Mighty".