Après avoir battu Dragon Champion Lance sur la version Pokémon LeafGreen, le joueur affrontera le vrai champion, qui est Gary. Face à Gary, le joueur devra jouer avec encore plus de stratégie que nécessaire en battant les membres de l'Elite Four parce que Gary a une équipe complète de Pokémon puissants.
Gary a les Pokémon suivants dans son équipe : Pidgeot de niveau 61, Alakazam de niveau 59 et un Rhydon de niveau 61. Si le joueur choisit Bulbasaur, Charmander ou Squirtle, Gary aura l'un des Pokémon suivants : Exeggutor de niveau 61, Gyarados de niveau 63, Charizar de niveau 65, Exeggutor de 63, Arcanin de niveau 61 Blastoise de niveau 65, Arcanin de niveau 63, Gyarados de niveau 61 et un Vénusaure de niveau 65.
Après avoir vaincu Gary, le professeur Oak parlera au joueur et entrera dans une arrière-salle pour lister le joueur et ses Pokémon dans le Hall of Fame.
