Chlamydia trachomatis a été découverte pour la première fois dans les yeux d'orangs-outans sur l'île de Java. Au cours d'expéditions de recherche sur la syphilis, les scientifiques Ludwig Halberstaedter et Stanislaus von Prowazek ont infecté des orangs-outans avec des raclures conjonctivales de patients atteints de trachome et ont découvert le organismes qu'ils ont nommés les Chlamydozoaires.
Les deux scientifiques ont publié la première étiologie de Chlamydia trachomatis en 1907. Selon Chlamydiae.com, ce n'est qu'en 1958 que d'autres scientifiques ont découvert que l'organisme est une bactérie et non un virus.
Selon la Review of Ophthalmology, la chlamydia est la maladie bactérienne sexuellement transmissible la plus courante dans le monde. La bactérie peut infecter plusieurs espèces animales en plus des humains, et elle provoque deux types d'infections oculaires à Chlamydia chez l'homme.
