Les pays voisins du Japon sont la Corée du Sud, la Corée du Nord, la Russie et la Chine. Le Japon est une nation archipélagique située en Asie orientale et entourée par l'océan Pacifique Nord et la mer du Japon.
Les quatre îles principales du Japon sont Honshu, Kyushu, Hokkaido et Shikoku. La péninsule coréenne est à environ 200 km de l'île de Kyushu, tandis que la côte russe est séparée de 186 km de l'île d'Hokkaido, bien que l'île russe de Shakhalin ne se trouve qu'à 37 km du Japon. Le terrain du Japon est principalement montagneux avec de fréquentes activités sismiques en raison des nombreux volcans actifs qui entourent le pays.