Les cartes Pokémon les plus rares sont les cartes Pikachu Illustrator. Il n'en existe que quatre dans le monde, et une a récemment été mise en vente sur eBay pour 100 000 $.
Les autres cartes Pokémon rares incluent les cartes Dresseur numéros 1, 2 et 3 ; les cartes Raichu de pré-lancement ; et les cartes Tropical Mega Battle 2001. La rareté des cartes d'entraîneur numéros 1, 2 et 3 est due au fait qu'une seule est publiée par an lors de la finale mondiale du JCC. Les éditeurs limitent les cartes Raichu en pré-lancement à 10 à 15 cartes dans le monde, avec une valeur estimée à plus de 10 000 $ par carte. Les éditeurs limitent le nombre de cartes Tropical Mega Battle 2001 à 12, ils se vendent donc plus de 10 000 $.
