Lorsqu'elle est réalisée par un chirurgien expérimenté et qualifié, le taux de réussite de l'opération de Whipple est de 96 %, selon le Centre USC pour les maladies pancréatiques et biliaires. Le taux de réussite peut atteindre 99 % dans les grands centres médicaux. installations qui effectuent un grand nombre de ces opérations chaque année, note WebMD.
Le niveau d'expérience du chirurgien et sa familiarité avec la procédure sont les facteurs les plus importants pour déterminer le taux de réussite de l'opération, selon l'American Cancer Society. Les taux de mortalité pour la procédure de Whipple peuvent atteindre 15 pour cent lorsqu'elle est effectuée dans des hôpitaux plus petits ou par des chirurgiens moins expérimentés. La Société conseille aux patients potentiels de rechercher des centres médicaux qui effectuent au moins 15 opérations de Whipple chaque année.