L'ibuprofène est relativement non polaire. En effet, il possède des groupes alkyle non polaires et un cycle benzénique qui réduit la polarité globale de la molécule apportée par son groupe carboxyle. Par conséquent, l'ibuprofène n'est que légèrement soluble dans l'eau, ne dissolvant que 21 milligrammes par litre d'eau à 25 degrés Celsius.
La propriété non polaire de l'ibuprofène le rend très soluble dans l'alcool et la plupart des solvants organiques. Afin de rendre l'ibuprofène plus soluble et à action plus rapide, il peut être mélangé avec du sel de lysine. Faire de l'ibuprofène un gel et le mélanger avec un solvant comme le 2-propanol, qui a une plus grande polarité, le rend plus facile à absorber à travers la couche intérieure polaire de la peau.