Les moucherons les plus courants dans une maison sont les moucherons des champignons, qui revendiquent le sol des plantes comme habitat. Les moucherons à l'intérieur d'une maison peuvent également être dus à la présence de mouches des fruits et/ou de mouches phoridées.
Les moucherons fongiques sont noirs et ressemblent à des asticots, et ils se rassemblent souvent près des fenêtres. Ces moucherons ne sont pas nocifs pour les racines de la plante. Une distinction pour séparer les mouches des fruits et les mouches phoridées des mouches des champignons est leur couleur, le brun. Les mouches des fruits sont particulièrement attirées par les cuisines, et un plat plein de vinaigre peut les éradiquer. Les fruits volent comme du vinaigre et se coincent à l'intérieur du plat. Les mouches Phorid proviennent en fait des conduites d'égout et de plomberie, ce qui peut indiquer un problème d'égout ou de fosse septique.
