Cabo San Lucas possède un petit aérodrome, l'aéroport international de Cabo San Lucas. Il dessert principalement le trafic des taxis aériens et l'aviation générale. Le transport aérien commercial vers cette zone est géré par l'aéroport international de Los Cabos, situé à San José del Cabo, à 47 km de Cabo San Lucas.
L'aéroport international de Los Cabos est le principal aéroport de la région de Los Cabos et accueille environ 3,35 millions de passagers par an, ce qui en fait le septième aéroport le plus fréquenté du Mexique. En 2015, l'aéroport abrite trois terminaux, avec un autre en construction, et accueille 22 transporteurs internationaux et nationaux. Les autres équipements incluent quatre hôtels, de nombreuses options de restauration, des services de navette et un parking.